Pasados 18 años, muerta ya la Santa, siendo Fray Diego de Yepes Prior de El Escorial murió el Rey Felipe II y su sucesor quiso premiarle los servicios prestados al Monarca durante su enfermedad y muerte, y lo presentó como Obispo de Tarazona.

En 1559 tomó posesión del Obispado y en 1600 ya empezó a edificar este convento pidiendo a la Orden de Carmelitas Descalzos le enviara las hermanas fundadoras.